Pico Muñalba
El Pico Muñalba es, con sus 2.074 metros, la máxima altitud de la Sierra de Neila y la segunda cumbre de la provincia. En el sureste de la Provincia de Burgos. Se accede a la cumbre desde el puerto de El Collado, situado entre Quintanar de la Sierra y Neila.Pastizales, enebros y piornos rastreros.
Páramo de Masa
Plano y austero paisaje en el que afloran varias lagunas de origen kárstico. En el norte de la Provincia de Burgos, entre las localidades de Masa y Poza de la Sal. Escasas formaciones vegetales que se ven reducidas a un matorral de brezo, tomillo y gayuba. Bosquetes aislados de encina y quejigo.
Montes de Somo y Valnera
Configuran uno de los paisajes más bellos de toda la región y constituyen un lugar ideal para el estudio del glaciarismo cuaternario. Situados en el extremo norte de la Provincia, en los términos municipales de Espinosa de los Monteros y Merindad de Sotoscueva. La vegetación presenta endemismos y especies boreoalpinas.
Montes de Ordunte
Frontera natural con las comunidades cántabra y vasca, destaca en su paisaje el pantano del río Ordunte. En el extremo noreste de la Provincia de Burgos, en el Valle de Menarobles. Hayas, madroños, corzo, jabalí, gato montés, marta, tejón, ardilla, garduña y nutria. Gavilanes, azores, halcones abejeros y ratoneros, lechuzas y búhos reales.
Montes de Oca
Interesante enclave medioambiental, en la divisoria natural de aguas entre las cuencas del Ebro y del Duero, al este de la Provincia de Burgos. Las poblaciones más importantes de su entorno son Belorado y Villafranca Montes de Oca.
Montes de Miranda de Ebro y Ameyugo
Las agrestes sierras que cierran la cuenca de Miranda de Ebro por su flanco meridional presentan un estado de conservación excepcional. En el extremo oriental de los Montes Obarenes, al sur de Miranda de Ebro. Pastizales, robledales, encinares, pinares, sabina mora y boj. Bosques de ribera. Buitre leonado, águila perdicera.
Montes de la Peña
El perfil característico de los Montes de la Peña, con su crestería caliza sirven de telón de fondo al Valle de Mena y a la vecina Merindad de Montija. En el norte de la Provincia, los Montes de la Peña son la divisoria entre el Valle de Mena y la Merindad de Montija en su vertiente norte, con la Junta de Traslaloma y el Valle de Losa en su vertiente sur.
Montes de la Engaña
Los Montes de la Engaña, en la divisoria cantábrica, están cubiertos de espesos bosques y sus tierras son recorridas por el río del mismo nombre. Situados en el extremo norte de la Provincia de Burgos, entre las merindades de Valdeporres y Sotoscueva, presentan bosques de hayas, robles y abedules, mientras entre la fauna destacan el lobo y la nutria.
Monte Hijedo
Una de las masas forestales caducifolias mejor conservadas de Castilla y León. En el extremo noroccidental de la Provincia de Burgos, se accede desde Arija y el Alfoz de Santa Gadea. Bosque mixto de robles, robur y albar, hayas, arces, abedules, acebos y tejos. Lobo, nutria, tejón, jabalí, pito negro, trepador azul y numerosas aves rapaces forestales.
El Paso de Las Calderas
El Paso de las Calderas, uno de los tesoros paisajísticos de la provincia de Burgos, es un farallón rocoso donde encontramos pozas, denominadas aquí calderas. En el sureste de la Provincia. Solo accesible a pie desde la Laguna Negra de Neila. Se accede a las lagunas Altas de Neila desde las localidades de Neila y Quintanar de la Sierra.