Pinares de Tubilla del Lago
Bosques de pino piñonero y resinero localizados en el sur de la Provincia, en la comarca de la ribera del Duero, entre las localidades de Tubilla del Lago y Villabilla de Gumiel. Uno de los aspectos más desconocidos de La Ribera es su riqueza forestal, que en la actualidad ha sido eclipsada por el viñedo.
Páramo de Masa
Plano y austero paisaje en el que afloran varias lagunas de origen kárstico. En el norte de la Provincia de Burgos, entre las localidades de Masa y Poza de la Sal. Escasas formaciones vegetales que se ven reducidas a un matorral de brezo, tomillo y gayuba. Bosquetes aislados de encina y quejigo.
Montes de Somo y Valnera
Configuran uno de los paisajes más bellos de toda la región y constituyen un lugar ideal para el estudio del glaciarismo cuaternario. Situados en el extremo norte de la Provincia, en los términos municipales de Espinosa de los Monteros y Merindad de Sotoscueva. La vegetación presenta endemismos y especies boreoalpinas.
Montes de Ordunte
Frontera natural con las comunidades cántabra y vasca, destaca en su paisaje el pantano del río Ordunte. En el extremo noreste de la Provincia de Burgos, en el Valle de Menarobles. Hayas, madroños, corzo, jabalí, gato montés, marta, tejón, ardilla, garduña y nutria. Gavilanes, azores, halcones abejeros y ratoneros, lechuzas y búhos reales.
Montes de Oca
Interesante enclave medioambiental, en la divisoria natural de aguas entre las cuencas del Ebro y del Duero, al este de la Provincia de Burgos. Las poblaciones más importantes de su entorno son Belorado y Villafranca Montes de Oca.
Montes de Miranda de Ebro y Ameyugo
Las agrestes sierras que cierran la cuenca de Miranda de Ebro por su flanco meridional presentan un estado de conservación excepcional. En el extremo oriental de los Montes Obarenes, al sur de Miranda de Ebro. Pastizales, robledales, encinares, pinares, sabina mora y boj. Bosques de ribera. Buitre leonado, águila perdicera.
Montes de la Peña
El perfil característico de los Montes de la Peña, con su crestería caliza sirven de telón de fondo al Valle de Mena y a la vecina Merindad de Montija. En el norte de la Provincia, los Montes de la Peña son la divisoria entre el Valle de Mena y la Merindad de Montija en su vertiente norte, con la Junta de Traslaloma y el Valle de Losa en su vertiente sur.
Montes de la Engaña
Los Montes de la Engaña, en la divisoria cantábrica, están cubiertos de espesos bosques y sus tierras son recorridas por el río del mismo nombre. Situados en el extremo norte de la Provincia de Burgos, entre las merindades de Valdeporres y Sotoscueva, presentan bosques de hayas, robles y abedules, mientras entre la fauna destacan el lobo y la nutria.
Monte Santiago
Frondoso y bien conservado hayedo que llega hasta el borde de un espectacular anfiteatro rocoso por el que se precipita, en épocas de deshielo o fuertes lluvias, el río Nervión, formando una cascada de 222 metros de altura. Localizado en el extremo noreste de la Provincia de Burgos, en la Sierra Salvada, al poco de pasar Berberana y antes de llegar al puerto de Orduña.
Monte Hijedo
Una de las masas forestales caducifolias mejor conservadas de Castilla y León. En el extremo noroccidental de la Provincia de Burgos, se accede desde Arija y el Alfoz de Santa Gadea. Bosque mixto de robles, robur y albar, hayas, arces, abedules, acebos y tejos. Lobo, nutria, tejón, jabalí, pito negro, trepador azul y numerosas aves rapaces forestales.